TY - JOUR AU - Misteli, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Beyond the sequence: cellular organization of genome function JO - Cell VL - 128 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.01.028 DO - 10.1016/j.cell.2007.01.028 ID - Misteli2007 ER - TY - JOUR AU - Lanctôt, C. AU - Cheutin, T. AU - Cremer, M. AU - Cavalli, G. AU - Cremer, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Dynamic genome architecture in the nuclear space: regulation of gene expression in three dimensions JO - Nat Rev Genet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2041 DO - 10.1038/nrg2041 ID - Lanctôt2007 ER - TY - JOUR AU - Solovei, I. AU - Kreysing, M. AU - Lanctôt, C. AU - Kösem, S. AU - Peichl, L. AU - Cremer, T. AU - Guck, J. AU - Joffe, B. PY - 2009 DA - 2009// TI - Nuclear architecture of rod photoreceptor cells adapts to vision in mammalian evolution JO - Cell VL - 137 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2009.01.052 DO - 10.1016/j.cell.2009.01.052 ID - Solovei2009 ER - TY - JOUR AU - Cremer, T. AU - Cremer, C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Chromosome territories, nuclear architecture and gene regulation in mammalian cells JO - Nat Rev Genet VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/35066075 DO - 10.1038/35066075 ID - Cremer2001 ER - TY - JOUR AU - Parada, L. AU - Misteli, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - Chromosome positioning in the interphase nucleus JO - Trends Cell Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/S0962-8924(02)02351-6 DO - 10.1016/S0962-8924(02)02351-6 ID - Parada2002 ER - TY - JOUR AU - Aubert, G. AU - Lansdorp, P. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Telomeres and aging JO - Physiol Rev VL - 88 UR - https://doi.org/10.1152/physrev.00026.2007 DO - 10.1152/physrev.00026.2007 ID - Aubert2008 ER - TY - JOUR AU - O’Sullivan, R. J. AU - Kerlseder, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Telomeres: protecting chromosomes against genome instability JO - Nat Reviews VL - 11 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2761 DO - 10.1038/nrg2761 ID - O’Sullivan2010 ER - TY - JOUR AU - Giraud-Panis, M. J. AU - Pisano, S. AU - Benarroch-Popivker, D. AU - Pei, B. AU - Le Du, M. H. AU - Gilson, E. PY - 2013 DA - 2013// TI - One identity or more for telomeres? JO - Frontiers in Oncology VL - 3 UR - https://doi.org/10.3389/fonc.2013.00048 DO - 10.3389/fonc.2013.00048 ID - Giraud-Panis2013 ER - TY - JOUR AU - Nagele, R. G. AU - Velasco, A. Q. AU - Anderson, W. J. AU - McMahon, D. J. AU - Thomson, Z. AU - Fazekas, J. AU - Wind, K. AU - Lee, H. PY - 2001 DA - 2001// TI - Telomere associations in interphase nuclei: possible role in maintenance of interphase chromosome topology JO - J Cell Sci VL - 114 ID - Nagele2001 ER - TY - JOUR AU - Amrichová, J. AU - Lukásová, E. AU - Kozubek, S. AU - Kozubek, M. PY - 2003 DA - 2003// TI - Nuclear and territorial topography of chromosome telomeres in human lymphocytes JO - Exp Cell Res VL - 289 UR - https://doi.org/10.1016/S0014-4827(03)00208-8 DO - 10.1016/S0014-4827(03)00208-8 ID - Amrichová2003 ER - TY - JOUR AU - Weierich, C. AU - Brero, A. AU - Stein, S. AU - von Hase, J. AU - Cremer, C. AU - Cremer, T. AU - Solovei, I. PY - 2003 DA - 2003// TI - Three-dimensional arrangements of centromeres and telomeres in nuclei of human and murine lymphocytes JO - Chromosome Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1023/A:1025016828544 DO - 10.1023/A:1025016828544 ID - Weierich2003 ER - TY - JOUR AU - Daniel, A. AU - St Heaps, L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Chromosome loops arising from intrachromosomal tethering of telomeres occur at high frequency in G1 (non-cycling) mitotic cells: Implications for telomere capture JO - Cell Chromosome VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/1475-9268-3-3 DO - 10.1186/1475-9268-3-3 ID - Daniel2004 ER - TY - JOUR AU - Chuang, T. C. AU - Moshir, S. AU - Garini, Y. AU - Chuang, A. Y. AU - Young, I. T. AU - Vermolen, B. AU - van den Doel, R. AU - Mougey, V. AU - Perrin, M. AU - Braun, M. AU - Kerr, P. D. AU - Fest, T. AU - Boukamp, P. AU - Mai, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - The three-dimensional organization of telomeres in the nucleus of mammalian cells JO - BMC Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1186/1741-7007-2-12 DO - 10.1186/1741-7007-2-12 ID - Chuang2004 ER - TY - JOUR AU - Zalenskaya, I. A. AU - Zalensky, A. O. PY - 2004 DA - 2004// TI - Non-random positioning of chromosomes in human sperm nuclei JO - Chromosome Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1023/B:CHRO.0000013166.04629.97 DO - 10.1023/B:CHRO.0000013166.04629.97 ID - Zalenskaya2004 ER - TY - JOUR AU - Solov'eva, L. AU - Svetlova, M. AU - Bodinski, D. AU - Zalensky, A. O. PY - 2004 DA - 2004// TI - Nature of telomere dimers and chromosome looping in human spermatozoa JO - Chromosome Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-005-5513-1 DO - 10.1007/s10577-005-5513-1 ID - Solov'eva2004 ER - TY - JOUR AU - Cowan, C. R. AU - Carlton, P. M. AU - Cande, W. Z. PY - 2002 DA - 2002// TI - Reorganization and polarization of the meiotic bouquet-stage cell can be uncoupled from telomere clustering JO - J Cell Sci VL - 115 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.00054 DO - 10.1242/jcs.00054 ID - Cowan2002 ER - TY - JOUR AU - Scherthan, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Factors directing telomere dynamics in synaptic meiosis JO - Biochem Soc Trans VL - 34 UR - https://doi.org/10.1042/BST0340550 DO - 10.1042/BST0340550 ID - Scherthan2006 ER - TY - JOUR AU - Taddei, A. AU - Hediger, F. AU - Neumann, F. R. AU - Bauer, C. AU - Gasser, S. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Separation of silencing from perinuclear anchoring functions in yeast Ku80, Sir4 and Esc1 proteins JO - EMBO J VL - 23 UR - https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7600144 DO - 10.1038/sj.emboj.7600144 ID - Taddei2004 ER - TY - JOUR AU - Bystricky, K. AU - Laroche, T. AU - van Houwe, G. AU - Blaszczyk, M. AU - Gasser, S. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Chromosome looping in yeast: telomere pairing and coordinated movement reflect anchoring efficiency and territorial organization JO - J Cell Biol VL - 168 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.200409091 DO - 10.1083/jcb.200409091 ID - Bystricky2005 ER - TY - JOUR AU - Therizols, P. AU - Fairhead, C. AU - Cabal, G. G. AU - Genovesio, A. AU - Olivo-Marin, J. C. AU - Dujon, B. AU - Fabre, E. PY - 2006 DA - 2006// TI - Telomere tethering at the nuclear periphery is essential for efficient DNA double strand break repair in subtelomeric region JO - J Cell Biol VL - 172 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.200505159 DO - 10.1083/jcb.200505159 ID - Therizols2006 ER - TY - JOUR AU - Mathog, D. AU - Hochstrasser, M. AU - Gruenbaum, Y. AU - Saumweber, H. AU - Sedat, J. PY - 1984 DA - 1984// TI - Characteristic folding pattern of polytene chromosomes in Drosophila salivary gland nuclei JO - Nature VL - 308 UR - https://doi.org/10.1038/308414a0 DO - 10.1038/308414a0 ID - Mathog1984 ER - TY - JOUR AU - Ermler, S. AU - Krunic, D. AU - Knoch, T. A. AU - Moshir, S. AU - Mai, S. AU - Greulich-Bode, K. M. AU - Boukamp, P. PY - 2004 DA - 2004// TI - Cell cycle-dependent 3D distribution of telomeres and telomere repeat-binding factor 2 (TRF2) in HaCaT and HaCaT-myc cells JO - Eur J Cell Biol VL - 83 UR - https://doi.org/10.1078/0171-9335-00430 DO - 10.1078/0171-9335-00430 ID - Ermler2004 ER - TY - JOUR AU - De Vos, W. H. AU - Hoebe, R. A. AU - Joss, G. H. AU - Haffmans, W. AU - Baatout, S. AU - Van Oostveldt, P. AU - Manders, E. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Controlled light exposure microscopy reveals dynamic telomere microterritories throughout the cell cycle JO - Cytometry A VL - 75 UR - https://doi.org/10.1002/cyto.a.20699 DO - 10.1002/cyto.a.20699 ID - De Vos2009 ER - TY - JOUR AU - Lansdorp, P. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Telomeres and disease JO - EMBO J VL - 28 UR - https://doi.org/10.1038/emboj.2009.172 DO - 10.1038/emboj.2009.172 ID - Lansdorp2009 ER - TY - JOUR AU - Calado, R. AU - Young, N. PY - 2012 DA - 2012// TI - Telomeres in disease JO - F1000 Med Rep VL - 4 ID - Calado2012 ER - TY - JOUR AU - Mai, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Initiation of telomere-mediated chromosomal rearrangements in cancer JO - J Cell Biochem VL - 109 ID - Mai2010 ER - TY - JOUR AU - Knecht, H. AU - Sawan, B. AU - Lichtensztejn, D. AU - Lemieux, B. AU - Wellinger, R. J. AU - Mai, S. PY - 2009 DA - 2009// TI - The 3D nuclear organization of telomeres marks the transition from Hodgkin to Reed-Sternberg cells JO - Leukemia VL - 23 UR - https://doi.org/10.1038/leu.2008.314 DO - 10.1038/leu.2008.314 ID - Knecht2009 ER - TY - JOUR AU - Knecht, H. AU - Brüderlein, S. AU - Mai, S. AU - Möller, P. AU - Sawan, B. PY - 2010 DA - 2010// TI - 3D structural and functional characterization of the transition from Hodgkin to Reed-Sternberg cells JO - Ann Anat VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/j.aanat.2010.07.006 DO - 10.1016/j.aanat.2010.07.006 ID - Knecht2010 ER - TY - JOUR AU - Robertson, J. D. AU - Gale, R. E. AU - Wynn, R. F. AU - Dougal, M. AU - Linch, D. C. AU - Testa, N. G. AU - Chopra, R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Dynamics of telomere shortening in neutrophils and T lymphocytes during ageing and the relationship to skewed X chromosome inactivation patterns JO - Br J Haematol VL - 109 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2141.2000.01970.x DO - 10.1046/j.1365-2141.2000.01970.x ID - Robertson2000 ER - TY - JOUR AU - Narducci, M. L. AU - Grasselli, A. AU - Biasucci, L. M. AU - Farsetti, A. AU - Mulè, A. AU - Liuzzo, G. AU - La Torre, G. AU - Niccoli, G. AU - Mongiardo, R. AU - Pontecorvi, A. AU - Crea, F. PY - 2007 DA - 2007// TI - High telomerase activity in neutrophils from unstable coronary plaques JO - J Am Coll Cardiol VL - 50 UR - https://doi.org/10.1016/j.jacc.2007.08.048 DO - 10.1016/j.jacc.2007.08.048 ID - Narducci2007 ER - TY - JOUR AU - Lunney, J. K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Advances in swine biomedical model genomics JO - Int J Biol Sci VL - 3 UR - https://doi.org/10.7150/ijbs.3.179 DO - 10.7150/ijbs.3.179 ID - Lunney2007 ER - TY - JOUR AU - Litten-Brown, J. C. AU - Corson, A. M. AU - Clarke, L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Porcine models for the metabolic syndrome, digestive and bone disorders: a general overview JO - Animal VL - 4 UR - https://doi.org/10.1017/S1751731110000200 DO - 10.1017/S1751731110000200 ID - Litten-Brown2010 ER - TY - JOUR AU - Yerle-Bouissou, M. AU - Mompart, F. AU - Iannuccelli, E. AU - Robelin, D. AU - Jauneau, A. AU - Lahbib-Mansais, Y. AU - Delcros, C. AU - Oswald, I. P. AU - Gellin, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Nuclear architecture of resting and LPS-stimulated porcine neutrophils by 3D FISH JO - Chromosome Res VL - 17 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-009-9074-6 DO - 10.1007/s10577-009-9074-6 ID - Yerle-Bouissou2009 ER - TY - JOUR AU - Knight, S. J. AU - Lese, C. M. AU - Precht, K. S. AU - Kuc, J. AU - Ning, Y. AU - Lucas, S. AU - Regan, R. AU - Brenan, M. AU - Nicod, A. AU - Lawrie, N. M. AU - Cardy, D. L. AU - Nguyen, H. AU - Hudson, T. J. AU - Riethman, H. C. AU - Ledbetter, D. H. AU - Flint, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - An optimized set of human telomere clones for studying telomere integrity and architecture JO - Am J Hum Genet VL - 67 UR - https://doi.org/10.1086/302998 DO - 10.1086/302998 ID - Knight2000 ER - TY - JOUR AU - Humphray, S. J. AU - Scott, C. E. AU - Clark, R. AU - Marron, B. AU - Bender, C. AU - Camm, N. AU - Davis, J. AU - Jenks, A. AU - Noon, A. AU - Patel, M. AU - Sehra, H. AU - Yang, F. AU - Rogatcheva, M. B. AU - Milan, D. AU - Chardon, P. AU - Rohrer, G. AU - Nonneman, D. AU - de Jong, P. AU - Meyers, S. N. AU - Archibald, A. AU - Beever, J. E. AU - Schook, L. B. AU - Rogers, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - A high utility integrated map of the pig genome JO - Genome Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2007-8-7-r139 DO - 10.1186/gb-2007-8-7-r139 ID - Humphray2007 ER - TY - JOUR AU - Ford, C. E. AU - Pollock, D. L. AU - Gustavsson, I. PY - 1980 DA - 1980// TI - Proccedings of the first international conference for the standardization of banded karyotypes of domestic animals JO - Hereditas VL - 92 UR - https://doi.org/10.1111/j.1601-5223.1980.tb01688.x DO - 10.1111/j.1601-5223.1980.tb01688.x ID - Ford1980 ER - TY - JOUR AU - Zhang, X. AU - Kluger, Y. AU - Nakayama, Y. AU - Poddar, R. AU - Whitney, C. AU - DeTora, A. AU - Weissman, S. M. AU - Newburger, P. E. PY - 2004 DA - 2004// TI - Gene expression in mature neutrophils: early responses to inflammatory stimuli JO - J Leukoc Biol VL - 75 UR - https://doi.org/10.1189/jlb.0903412 DO - 10.1189/jlb.0903412 ID - Zhang2004 ER - TY - JOUR AU - Gao, Y. AU - Flori, L. AU - Lecardonnel, J. AU - Esquerré, D. AU - Hu, Z. L. AU - Teillaud, A. AU - Lemonnier, G. AU - Lefèvre, F. AU - Oswald, I. P. AU - Rogel-Gaillard, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Transcriptome analysis of porcine PBMCs after in vitro stimulation by LPS or PMA/ionomycin using an expression array targeting the pig immune response JO - BMC Genomics VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-11-292 DO - 10.1186/1471-2164-11-292 ID - Gao2010 ER - TY - JOUR AU - Solinhac, R. AU - Mompart, F. AU - Martin, P. AU - Robelin, D. AU - Pinton, P. AU - Iannuccelli, E. AU - Lahbib-Mansais, Y. AU - Oswald, I. P. AU - Yerle-Bouissou, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Transcriptomic and nuclear architecture of immune cells after LPS activation JO - Chromosoma VL - 120 UR - https://doi.org/10.1007/s00412-011-0328-7 DO - 10.1007/s00412-011-0328-7 ID - Solinhac2011 ER - TY - JOUR AU - Brinkmann, V. AU - Reichard, U. AU - Goosmann, C. AU - Fauler, B. AU - Uhlemann, Y. AU - Weiss, D. S. AU - Weinrauch, Y. AU - Zychlinsky, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Neutrophil extracellular traps kill bacteria JO - Science VL - 303 UR - https://doi.org/10.1126/science.1092385 DO - 10.1126/science.1092385 ID - Brinkmann2004 ER - TY - JOUR AU - Kaplan, M. J. AU - Radic, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Neutrophil extracellular traps: double-edged swords of innate immunity JO - J Immunol VL - 189 UR - https://doi.org/10.4049/jimmunol.1201719 DO - 10.4049/jimmunol.1201719 ID - Kaplan2012 ER - TY - JOUR AU - Iannuccelli, E. AU - Mompart, F. AU - Gellin, J. AU - Lahbib-Mansais, Y. AU - Yerle, M. AU - Boudier, T. PY - 2010 DA - 2010// TI - NEMO: a tool for analyzing gene and chromosome territory distributions from 3D-FISH experiments JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq013 DO - 10.1093/bioinformatics/btq013 ID - Iannuccelli2010 ER - TY - JOUR AU - Tam, R. AU - Smith, K. P. AU - Lawrence, J. B. PY - 2004 DA - 2004// TI - The 4q subtelomere harboring the FSHD locus is specifically anchored with peripheral heterochromatin unlike most human telomeres JO - J Cell Biol VL - 167 UR - https://doi.org/10.1083/jcb.200403128 DO - 10.1083/jcb.200403128 ID - Tam2004 ER - TY - JOUR AU - Ramírez, M. J. AU - Surrallés, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Laser confocal microscopy analysis of human interphase nuclei by three-dimensional FISH reveals dynamic perinucleolar clustering of telomeres JO - Cytogenet Genome Res VL - 122 UR - https://doi.org/10.1159/000167809 DO - 10.1159/000167809 ID - Ramírez2008 ER - TY - JOUR AU - Wang, X. AU - Kam, Z. AU - Carlton, P. M. AU - Xu, L. AU - Sedat, J. W. AU - Blackburn, E. H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Rapid telomere motions in live human cells analyzed by highly time-resolved microscopy JO - Epigenetics Chromatin VL - 1 UR - https://doi.org/10.1186/1756-8935-1-4 DO - 10.1186/1756-8935-1-4 ID - Wang2008 ER - TY - JOUR AU - Quina, A. S. AU - Parreira, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Telomere-surrounding regions are transcription-permissive 3D nuclear compartments in human cells JO - Exp Cell Res VL - 307 UR - https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2005.02.025 DO - 10.1016/j.yexcr.2005.02.025 ID - Quina2005 ER - TY - JOUR AU - Déjardin, J. AU - Kingston, R. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Purification of proteins associated with specific genomic Loci JO - Cell VL - 136 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.11.045 DO - 10.1016/j.cell.2008.11.045 ID - Déjardin2009 ER - TY - JOUR AU - Groenen, M. A. AU - Archibald, A. L. AU - Uenishi, H. AU - Tuggle, C. K. AU - Takeuchi, Y. PY - 2012 DA - 2012// TI - Analyses of pig genomes provide insight into porcine demography and evolution JO - Nature VL - 491 UR - https://doi.org/10.1038/nature11622 DO - 10.1038/nature11622 ID - Groenen2012 ER - TY - JOUR AU - Foster, H. A. AU - Griffin, D. K. AU - Bridger, J. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Interphase chromosome positioning in in vitro porcine cells and ex vivo porcine tissues JO - BMC Cell Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2121-13-30 DO - 10.1186/1471-2121-13-30 ID - Foster2012 ER - TY - JOUR AU - Yerle, M. AU - Schmitz, A. AU - Milan, D. AU - Chaput, B. AU - Monteagudo, L. AU - Vaiman, M. AU - Frelat, G. AU - Gellin, J. PY - 1993 DA - 1993// TI - Accurate characterization of porcine bivariate flow karyotype by PCR and fluorescence in situ hybridization JO - Genomics VL - 16 UR - https://doi.org/10.1006/geno.1993.1146 DO - 10.1006/geno.1993.1146 ID - Yerle1993 ER - TY - JOUR AU - Yerle, M. AU - Goureau, A. AU - Gellin, J. AU - Le Tissier, P. AU - Moran, C. PY - 1994 DA - 1994// TI - Rapid mapping of cosmid clones on pig chromosomes by fluorescence in situ hybridization JO - Mamm Genome VL - 5 UR - https://doi.org/10.1007/BF00360565 DO - 10.1007/BF00360565 ID - Yerle1994 ER - TY - BOOK PY - 2005 DA - 2005// TI - R: A language and environment for statistical computing PB - R Foundation for Statistical Computing CY - Vienna, Austria ID - ref52 ER -