Table 16 RR estimated LPM predicting O-glycosylation probabilities given structural and sequence data

intercept

0.3124

0.0322

m8N

-0.0595

0.0496

p7T

-0.0660

0.0364

m1D

0.0343

0.0415

m8P

-0.0638

0.0336

p7V

-0.0556

0.0386

m1L

0.0560

0.0307

m8V

-0.0687

0.0433

p7Y

0.0463

0.0439

m1P

0.1345

0.0687

p1A

-0.0119

0.0435

p8H

0.0487

0.0459

m1R

-0.0671

0.0391

p1D

0.0614

0.0474

p8K

0.0037

0.0409

m3A

0.0127

0.0368

p1F

0.0657

0.0396

p8N

0.0638

0.0428

m3C

-0.0633

0.0473

p1S

-0.0007

0.0383

p8Q

0.0082

0.0414

m3L

0.0228

0.0316

p1T

0.0664

0.0391

pos

0.0338

0.0417

m3N

-0.0528

0.0703

p1V

-0.0329

0.0323

ASA_zero

0.1204

0.0690

m3T

-0.0515

0.0406

p2A

0.0554

0.0465

II

-0.0266

0.0547

m4E

-0.0219

0.0543

p2H

0.0169

0.0592

II´

-0.0616

0.0678

m4F

0.0251

0.0377

p2P

0.0788

0.0349

Helix

0.0603

0.0271

m4N

0.0548

0.0464

p2Q

-0.0658

0.0444

Beta Bridges

0.1283

0.0588

m4R

0.0669

0.0476

p2Y

-0.0701

0.0602

Beta Hairpin

0.1353

0.0689

m4V

-0.0619

0.0309

p3N

-0.0574

0.0469

Beta Hairpin Strand

-0.0641

0.0264

m5D

0.0553

0.0444

p3W

-0.0584

0.0619

Phi angle

0.0001

0.0002

m5F

-0.0751

0.0465

p4A

0.0642

0.0406

m5G

-0.0351

0.0482

p4E

0.0139

0.0350

m5I

-0.0408

0.0478

p4P

0.0384

0.0359

m5Y

-0.0577

0.0482

p5C

-0.0702

0.0473

m6E

0.0249

0.0338

p5E

-0.0222

0.0471

m6H

-0.0693

0.0579

p5H

0.0701

0.0540

m6V

0.0545

0.0395

p5I

-0.0552

0.0419

m6W

0.0067

0.0525

p5Q

0.0310

0.0511

m6Y

-0.0589

0.0450

p5T

-0.0380

0.0371

m7A

0.0418

0.0381

p5Y

-0.0697

0.0546

m7E

-0.0655

0.0398

p6F

-0.0644

0.0482

m7G

-0.0569

0.0348

p6G

-0.0540

0.0418

m7H

0.0707

0.0491

p6M

0.0608

0.0620

m7I

-0.0053

0.0385

p6N

-0.0695

0.0438

m7K

0.0396

0.0409

p6Q

-0.0782

0.0484

m7S

-0.0403

0.0433

p7A

0.0765

0.0562

m8G

0.0512

0.0390

p7C

-0.0576

0.0493

m8L

-0.0587

0.0351

p7E

-0.0513

0.0393

m8M

-0.0693

0.0525

p7G

0.0306

0.0383